Где R хранит пакеты?

Функция install.packages() в R – это автоматическая утилита для распаковки, которая получает и устанавливает пакеты в R.

  1. Как узнать, какой каталог R выбрал для хранения пакетов?

  2. Как я могу изменить каталог, в котором R хранит и получает доступ к пакетам?

Команда install.packages просматривает переменную .libPaths. Вот что мое по умолчанию на OSX:

 > .libPaths() [1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library" 

Я не устанавливаю там пакеты по умолчанию, я предпочитаю, чтобы они были установлены в моем домашнем каталоге. В моем .Rprofile у меня есть эта строка:

 .libPaths( "/Users/tex/lib/R" ) 

Это добавляет каталог «/ Users / tex / lib / R» в начало переменной .libPaths.

Это описано в руководстве по установке и администрированию R, которое прилагается к вашей установке.

На моем Linux-боксе:

 R> .libPaths() [1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library" [3] "/usr/lib/R/library" R> 

это означает, что путь по умолчанию является первым из них. Вы можете переопределить это через аргумент как install.packages() (изнутри R), так и R CMD INSTALL (вне R).

Вы также можете переопределить, установив переменную R_LIBS_USER.

Спасибо за направление от двух вышеупомянутых ответчиков. Предложение Джеймса Томпсона лучше всего подходит для пользователей Windows.

  1. Перейдите к месту установки вашей программы R. В литературе это упоминается как R_Home . Как только вы его найдете, перейдите в подкаталог / etc.

     C:\R\R-2.10.1\etc 
  2. Выберите файл в этой папке с именем Rprofile.site. Я открываю его с помощью VIM. Вы увидите, что это файл с голыми костями с менее чем 20 строками кода. Я вставил внутри кода следующее:

     # my custom library path .libPaths=("C:/R/library") 

– добавлен комментарий, чтобы отслеживать, что я сделал с файлом.

  1. В R, набрав .libPaths() первая цель в C:/R/Library

ПРИМЕЧАНИЕ. Вероятно, существует более чем один способ достичь этого, но другие методы, которые я пытался, по какой-то причине не работали.

Вы не хотите, чтобы ‘=’

Используйте .libPaths("C:/R/library") в файле Rprofile .site

И убедитесь, что у вас есть правильный символ (Shift-2)

Давайте будем гением компьютера.